Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms