Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGCXP38435 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGCXP38435 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms