Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LTBRP36941 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LTBRP36941 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms