Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms