Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms