Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYKP34925 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYKP34925 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYKP34925 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYKP34925 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms