Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CASQ1P31415 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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CASQ1P31415 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CASQ1P31415 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CASQ1P31415 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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CASQ1P31415 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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CASQ1P31415 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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CASQ1P31415 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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