Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRBP28702 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRBP28702 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRBP28702 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRBP28702 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRBP28702 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRBP28702 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRBP28702 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms