Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms