Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NFYAP23511 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NFYAP23511 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NFYAP23511 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NFYAP23511 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NFYAP23511 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NFYAP23511 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NFYAP23511 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NFYAP23511 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFYAP23511 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFYAP23511 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms