Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT1P21579 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT1P21579 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT1P21579 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT1P21579 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms