Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms