Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms