Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL2P13500 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL2P13500 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL2P13500 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL2P13500 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms