Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms