Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HKR1P10072 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HKR1P10072 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HKR1P10072 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HKR1P10072 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms