Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA8P0DM63 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms