Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3P09919 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms