Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYBBP04839 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms