Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNB1P01574 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms