Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms