Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms