Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-1B6SEH8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms