Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM5B3KS81 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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