Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPBD1B2RD01 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms