Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms