Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAV27A0A087WT01 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV27A0A087WT01 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms