Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms