Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms