Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms