Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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