Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKQ9UM73 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms