Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EPDR1Q9UM22 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EPDR1Q9UM22 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms