Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms