Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms