Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms