Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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