Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms