Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCL11BQ9C0K0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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