Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms