Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms