Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms