Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms