Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms