Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX2Q9BQ50 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms