Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC7Q96NW7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms