Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms