Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLMNQ96JQ2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms