Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EAF1Q96JC9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms