Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms